Pada awal Agustus 2023, Hendra resmi menjabat sebagai Wakil Ketua BPK menggantikan Agus Joko Pramono yang telah habis masa jabatannya. Sebelum menjadi Wakil Ketua BPK, Hendra pernah menjabat sebagai Anggota VII BPK periode 2022-2023. Hendra juga pernah menjadi Anggota I BPK periode 2019 hingga 2022.
Dikutip dari laman BPK RI, Ia mengawali karir di BPK sebagai Aparatur Sipil Negara (ASN) golongan III pada tahun 1999. Hendra diketahui memiliki banyak pengalaman di bidang pemeriksaan keuangan negara/daerah.
Beberapa jabatan struktural dan fungsional di BPK juga pernah diembannya. Antara lain Kepala Seksi Jambi II.A pada BPK Perwakilan Provinsi Jambi, Pengendali Teknis pada BPK Perwakilan Provinsi Banten, dan Kepala Auditorat pada Auditorat Utama Keuangan Negara I.